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廣西醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，下設(shè)學(xué)院辦公室、教研科、學(xué)生工作辦公室、學(xué)院團委4個行政職能部門，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系、生命科學(xué)與技術(shù)系、生物醫(yī)學(xué)工程系、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗教學(xué)中心4個教學(xué)系（中心）和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗中心、廣西“神經(jīng)生物學(xué)研究”特聘專家實驗室2個科研實驗室，其中基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)系涵蓋6個教研室即微生物學(xué)教研室、免疫學(xué)教研室、人體解剖學(xué)教研室、組織學(xué)與胚胎學(xué)教研室、病理生理學(xué)教研室、寄生蟲學(xué)教研室，生命科學(xué)與技術(shù)系涵蓋4個教研室即生理學(xué)教研室、生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室、生物技術(shù)教研室、細(xì)胞生物學(xué)與遺傳學(xué)教研室，生物醫(yī)學(xué)工程系涵蓋4個教研室即物理學(xué)教研室、電子學(xué)教研室、醫(yī)療儀器與臨床工程教研室、數(shù)學(xué)與信息工程教研室，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)實驗教學(xué)中心涵蓋3個教學(xué)實驗室（中心）即實驗生理科學(xué)實驗中心、形態(tài)學(xué)實驗室、分子醫(yī)學(xué)教學(xué)實驗室。